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非编码RNA测序

  日期:2014-11-12  浏览:


       非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)是指各种不编码蛋白质的RNA分子。细胞中含量最高的是rRNA和tRNA,广义上的非编码RNA包括这两种RNA,但狭义上的非编 码RNA不包括rRNA和tRNA。在近十余年的生命科学研究中,非编码调控RNA是研究热门的领域之一。ncRNA在发育和基因表达中发挥的复杂精确的调控功能极大地解释了基因组复杂性难题,同时也为人们从基因表达调控网络的维度来认识生命体的复杂性开启新的天地。常见的具调控作用的非编码RNA包括 siRNA、miRNA、piRNA等small RNA以及长链非编码RNA (Long noncoding RNAs,LncRNAs)。


       长期以来,分子生物学研究的重点都在蛋白编码基因上,而一些重要的生命活动如生长发育、细胞的发生和分化、神经系统的分化等都被一些非蛋白编码small RNA调控。small RNA的研究给我们带来比其本身更为重要的启示是基因组非组蛋白编码区蕴含着重要的生命功能活动信息。
       

       通过实时定量PCR以及基因芯片技术研究Small RNA,主要关注Small RNA的表达和定量,仅局限于研究那些序列信息或二级茎环结构信息已知的Small RNA,无法寻找和发现新的Small RNA分子。基于高通量测序技术的Small RNA测序技术突破了这些研究技术手段的局限性,使研究人员能够直接对样本中的Small RNA进行高通量测序。


       人们对lncRNA的认识还处在初级阶段,lncRNA起初被认为是基因组转录的“噪音”,是RNA聚合酶II转录的副产物,不具有生物学功能。然而,近 年来的研究表明,lncRNA参与了X染色体沉默、染色质修饰、基因组印记、转录激活、转录干扰以及核内运输等多种重要的调控过程。通过借鉴国际前沿研究方法,倾力开发挖掘lncRNA分析方法,可为生物学家研究lncRNA提供强大的技术支持。